Azt, hogy az egyes tagországok hány csapatot indíthattak a tornán, az UEFA 2005-ös nemzeti koefficiense alapján határozták meg. Mivel Liechtenstein nem rendezett saját nemzeti bajnokságot, emiatt nem indíthatott csapatot a Bajnokok Ligájában. Habár Andorra és San Marino rendezett saját nemzeti bajnokságot, a tornára csapatot nem nevezett. A Montenegrói Labdarúgó-szövetség 2006. június 28-án vált ismét függetlenné, és 30-án be is adták kérelmüket az UEFÁhoz és a FIFÁhoz felvételre, azonban az UEFA csak 2007. január 26-án, a FIFA pedig 2007. május 31-én fogadta el a kérelmet, így a torna kezdetekor még nem volt UEFA-tag, ennek megfelelően csapatot sem indíthatott. A listán elfoglalt helyezésük alapján különböző mennyiségű csapatot indíthattak az adott országok az alábbiak alapján:
Az 1–3. tagországok 4-4 csapatot indíthattak
A 4–6. tagországok 3-3 csapatot indíthattak
A 7–15. tagországok 2-2 csapatot indíthattak
A 16–50. tagországok 1-1 csapatot indíthattak (kivéve Liechtenstein)
Az egyes tagországok 2005-ös nemzeti koefficiense:[1]
SRB A Crvena zvezda a 2005–2006-os szerb-montenegrói nemzeti bajnokság megnyerésével kvalifikálta magát a tornára, azonban a torna kezdetekor már a Szerb Labdarúgó-szövetség tagja volt, melyet az UEFA a szerb-montenegrói szövetség hivatalos jogutódjaként ismert el.[3]
ITA A 2005–2006-os olasz nemzeti bajnokság végeredménye szerint a következő csapatoknak kellett volna indulniuk: Juventus, Milan, Internazionale és Fiorentina, azonban a 2006-os olasz bundabotrány miatt ez megváltozott. Az Internazionale és a Roma indulhatott a csoportkörben, míg a Milan és a Chievo a harmadik selejtezőkörben kezdhette a tornát. Eredetileg a Milan csapatát is kizárták a tornáról, azonban fellebbezésüket elfogadták.
Selejtezők
Fő: A 2006–2007-es Bajnokok Ligája selejtezői
Első selejtezőkör
1. csapat
Össz.
2. csapat
1. meccs
2. meccs
Elbasan
1–3
Ekranas
1–0
0–3
Szioni
2–1
Bakı
2–0
0–1
Dudelange
0–1
Rabotnicski
0–1
0–0
Pjunik
0–2
Sheriff
0–0
0–2
Birkirkara
2–5
B36
0–3
2–2
Linfield
3–5
Gorica
1–3
2–2
TVMK
3–4
FH
2–3
1–1
MYPA
2–0
TNS
1–0
1–0
Cork City
2–1
Apólon
1–0
1–1
Sahcjor
0–2
Široki Brijeg
0–1
0–1
Liepājas Metalurgs
2–1
Aqtöbe
1–0
1–1
Második selejtezőkör
1. csapat
Össz.
2. csapat
1. meccs
2. meccs
Ekranas
3–9
Dinamo Zagreb
1–4
2–5
Fenerbahçe
9–0
B36
4–0
5–0
Mladá Boleslav
5–3
Vålerenga
3–1
2–2
Sheriff
1–1 (i.g.)
Szpartak Moszkva
1–1
0–0
Liepājas Metalurgs
1–8
Dinamo Kijiv
1–4
0–4
FH
0–3
Legia
0–1
0–2
København
4–2
MYPA
2–0
2–2
Gorica
0–5
Steaua
0–2
0–3
Levszki
4–0
Szioni
2–0
2–0
Zürich
2–3
Salzburg
2–1
0–2
Djurgården
2–3
Ružomberok
1–0
1–3
Debrecen
2–5
Rabotnicski
1–1
1–4
Cork City
0–4
Crvena zvezda
0–1
0–3
Hearts
3–0
Široki Brijeg
3–0
0–0
Harmadik selejtezőkör
1. csapat
Össz.
2. csapat
1. meccs
2. meccs
Austria Wien
1–4
Benfica
1–1
0–3
Dinamo Zagreb
1–5
Arsenal
0–3
1–2
Hamburg
1–1 (i.g.)
Osasuna
0–0
1–1
Liverpool
3–2
M. Haifa
2–1
1–1
Salzburg
1–3
Valencia
1–0
0–3
Milan
3–1
Crvena zvezda
1–0
2–1
Galatasaray
6–3
Mladá Boleslav
5–2
1–1
Standard
3–4
Steaua
2–2
1–2
Liberec
1–2
Szpartak Moszkva
0–0
1–2
Sahtar Doneck
4–2
Legia
1–0
3–2
Levszki
4–2
Chievo
2–0
2–2
Hearts
1–5
AEK
1–2
0–3
CSZKA Moszkva
5–0
Ružomberok
3–0
2–0
[[Ez a csapat még nem szerepel a sablonban. Szerkesztés|Lille]] [[Kép:Ez a csapat még nem szerepel a sablonban. Szerkesztés.png|20px|link=|alt=]]
4–0
Rabotnicski
3–0
1–0
Dinamo Kijiv
5–3
Fenerbahçe
3–1
2–2
København
3–2
Ajax
1–2
2–0
Csoportkör
Fő: A 2006–2007-es Bajnokok Ligája csoportköre
Sorrend meghatározása
Természetesen elsődlegesen a megszerzett pontok száma rangsorolt. A győzelemért három, a döntetlenért egy, a vereségért pedig nulla pont járt. Ha két vagy több csapat a hat lejátszott mérkőzés során azonos mennyiségű pontot szerzett, az alábbiak alapján kellett meghatározni a sorrendet:[4]
az ugyanannyi pontot szerző csapatok egymás elleni mérkőzésein szerzett több pont
az ugyanannyi pontot szerző csapatok egymás elleni mérkőzésein elért jobb gólkülönbség
az ugyanannyi pontot szerző csapatok egymás elleni mérkőzésein idegenben szerzett több gól
az ugyanannyi pontot szerző csapatok által az összes mérkőzésen elért jobb gólkülönbség
az ugyanannyi pontot szerző csapatok által az összes mérkőzésen szerzett több gól
az előző öt szezonban elért jobb klub- (67%) és nemzeti (33%) UEFA koefficiens
Színmagyarázat a csoporttáblázatokhoz
A csoportgyőztesek és második helyezettek továbbjutottak a nyolcaddöntőbe
A harmadik helyezettek bejutottak a 2006–2007-es UEFA-kupalegjobb 32 csapata közé
A torna hivatalos góllövőlistáját a selejtezőkön szerzett találatok nélkül tartják nyilván, azaz a torna gólkirálya az volt, aki a csoportkörtől kezdődően a legtöbb gólt szerezte. Az alábbi táblázat tartalmazza a góllövőlista élmezőnyét:
Hely.
Név
Klub
Gólok
Játszott percek
1.
Kaká
Milan
10
1142'
2.
van Nistelrooy, RuudRuud van Nistelrooy
Real Madrid
6
0584'
3.
Morientes, FernandoFernando Morientes
Valencia
6
0619'
4.
Crouch, PeterPeter Crouch
Liverpool
6
0665'
5.
Drogba, DidierDidier Drogba
Chelsea
6
1054'
6.
Raúl González
Real Madrid
5
0603'
7.
Saha, LouisLouis Saha
Man. United
4
0464'
8.
Dică, NicolaeNicolae Dică
Steaua
4
0531'
9.
Pizarro, ClaudioClaudio Pizarro
Bayern
4
0620'
10.
Villa, DavidDavid Villa
Valencia
4
0656'
11.
Inzaghi, FilippoFilippo Inzaghi
Milan
4
0673'
12.
Totti, FrancescoFrancesco Totti
Roma
4
0800'
13.
Rooney, WayneWayne Rooney
Man. United
4
1063'
14.
Cruz, JulioJulio Cruz
Internazionale
3
0227'
15.
van der Vaart, RafaelRafael van der Vaart
Hamburg
3
0270'
16.
Luis García
Liverpool
3
0336'
17.
Guðjohnsen, EiðurEiður Guðjohnsen
Barcelona
3
0396'
18.
Castillo
Olimbiakósz Pireósz
3
0430'
19.
Allbäck, MarcusMarcus Allbäck
København
3
0440'
20.
Miller, KennyKenny Miller
Celtic
3
0469'
21.
López, LisandroLisandro López
Porto
3
0588'
22.
González, LuchoLucho González
Porto
3
0720'
23.
Sevcsenko, AndrijAndrij Sevcsenko
Chelsea
3
0769'
24.
Gerrard, StevenSteven Gerrard
Liverpool
3
0858'
25.
Cristiano Ronaldo
Man. United
3
0959'
Alapvető sorrend: Gólok (csökkenő), Játszott percek (növekvő), Klub, Név
Forrás: Top Scorers. Hozzáférés: 2011. június 7-én.